ustanovljen leta 2010, se osredotoča na:
- raziskovanje in dokumentacijo na področju humanistike in družboslovja
- raziskovanje kulturne dediščine in izdelavo konservatorskih načrtov
- dokumentacijo in vzdrževanja elektronske baze podatkov Judovskega arhiva Slovenije
- študij provenience
V letu 2019 je inštitut pridobil status znanstvenoraziskovalnega centra, ki ga priznava Javna agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije (ARRS). Ustanovljena je bila nova sekcija: Znanstvenoraziskovalni center JAS.
Rezultat delovanja zavoda so številne publikacije znanstvenih, strokovnih in poljudnih vsebin, elaborati konservatorskih načrtov za kulturne spomenike, predavanja in strokovna vodstva, organizacija delavnic … saj nam je pomembno, da rezultati raziskav pridejo do zainteresirane javnosti in ji širijo obzorja.